同安区境，商代属扬州地，周代为七闽地，春秋战国时属越地，秦属闽中郡。西汉初属闽越国，元封元年（前110年）属会稽郡。东汉属闽侯官县地，三国时属建安郡东安县。晋太康三年（282年）析东安县置同安县，当年即废，属晋安县。隋开皇九年（589年）属南安县。唐贞元十九年（803年）析南安4乡置大同场，为同安县之前身。五代后唐长兴四年（933年）正式升场置县，辖3乡11里，包括前厦门市、同安县、金门县及龙海市一部分。元，改里为都，共3乡44都。明初，恢复里，又增设在坊里（县城区），辖2隅，共3乡12里2隅44都。成化初，都下设图，共3乡12里2隅37都统53图。清乾隆四十年（1775年），析民安、翔风2里及同禾里之五、六、七都置马巷厅。光绪间行保甲制，改图为保。清末民初，同安县区划建制层级为县、乡、里、都、保、甲6级。民国元年（1912年），裁马巷厅复归同安县。民国3年1月，析大小嶝、金门岛及嘉禾里置思明县，次年再由思明县析大小嶝、大小金门岛置金门县。民国3年，同安县辖区3个乡11个里27个都。民国36年，辖13个乡镇150个保2325个甲，保持至1949年9月同安解放。1953年11月，划集美乡归厦门市。1957年3月，析灌口区锦宅、金山2个乡划归龙溪县；4月18日，再将灌口区其余12个乡划给厦门市，设厦门市郊区。1971年3月，划南安县大嶝公社及石井公社的莲河、霞浯2个大队归属同安县。1997年5月撤县设区。2003年9月，东部新圩、内厝、马巷、新店、大嶝5个镇和大帽山农场析出设立翔安区。同安县辖域面积由解放初的1481平方公里，到1971年缩小为1078.55平方公里，到2003年减为657.59平方公里。同安县的上级建制宋至清均属泉州（路、府），民国初废府，改隶于厦门道。民国17年，直隶于福建省。民国24年，改隶福建省第四专员公署至解放。新中国成立后先后2次隶属于晋江专区，1973年9月起隶属于厦门市至今。